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SUPERGreenI(效果同SYBR Green I)核酸染料

更新時間:2020-01-03點擊次數:1576

本品用DMSO溶解,因DMSO的熔點是18.5℃,使用前請放置到室溫充分溶解。
SUPER Green I核酸染料特點
● 無毒性:屬花箐類染料,容易生物降解,無致癌毒性。
● 靈敏度高:至少可檢出20pg DNA,高于EB染色法25~100倍。
● 信噪比高:樣品熒光信號強,背景信號低。
● 操作簡單:無須脫色或沖洗,即可直接用紫外凝膠透射儀或可見光透射儀觀察。
● 適用范圍廣:可適用于多種凝膠電泳方法:瓊脂糖凝膠、聚丙烯酰胺凝膠電泳、脈沖電場凝膠電泳和毛細管電泳等。
● 使用方便:對分子生物學中常用的酶(如:Taq 酶、反轉錄酶、內切酶、T4連接酶等)沒有抑制作用。
● 經濟:價格比銀染便宜。
SUPER Green I使用方法簡介
1.膠染法(用法同EB)
(1) 制膠時加入SUPER Green I 核酸染料。冷卻膠至50℃左右,每100mL膠中加入3~5μL
SUPER Green I 核酸染料。
(2) 按照常規方法進行電泳即可。
注:此方法染色可以準確確定核酸片段分子量,染料用量相對較少。1mL染料大約可以做300塊 100mL的膠。
2.點染法
(1) 該方法適于瓊脂糖凝膠電泳和PAGE凝膠電泳。
(2) 工作液的配制:用電泳緩沖液將10000×的SUPER Green I 稀釋100倍,即為SUPER Green I 工作液。SUPER Green I 工作液可以置2~8℃保存一個月以上。
(3) 制膠:按常規方法制膠,不含任何染料。
(4) 樣品染色:向分析樣品中加入SUPER Green I 工作液和載樣緩沖液,室溫放置10分鐘,使SUPER Green I 與樣品中DNA充分結合。SUPER Green I 工作液加入量為總上樣量的1/5~1/10。
(5) DNA Marker染色:將5μL DNA Marker、5μL DNA Marker稀釋液和1μLSUPER Green I 工作液混勻,室溫放置5分鐘,使SUPER Green I 與DNA充分結合。
(6) 上樣、電泳:按常規操作。
注:用點染法染色時,靈敏度高,染料用量少。但大片段稍有滯后現象,如果需要更準確確定分子量(與Marker對比),建議使用膠染法。
3.泡染法
(1) 按照常規方法進行電泳。
(2) 用pH 7.0~8.5 的緩沖液(如:TAE,TBE 或 TE),按照10000﹕1的比例稀釋SUPER Green I 濃縮液,混勻,制成染色溶液。
(3) 將染色溶液倒入合適的聚丙烯容器中,放入凝膠,用鋁箔等蓋住容器使染料避光。室溫振蕩染色10~30分鐘,染色時間因凝膠濃度和厚度而定。聚丙烯酰胺凝膠直接在玻璃平皿上染色,將配好的稀釋溶液輕輕地倒在膠板上,讓稀釋液均勻地覆蓋整個膠板,并染色30分鐘。玻璃平皿必須預先經過硅烷化溶液處理(避免染料吸附在玻璃表面上)。
注:用泡染法染色時,可以精確確定核酸片段分子量。但染料用量是三種方法中多的。
4.  點染+膠染法

此法結合方法1和方法2,靈敏度高,對于低濃度樣本比EB檢測更靈敏。

SUPER Green I使用注意事項
(1) 在SUPER Green I點染法中,電泳時間不要超過2小時,否則SUPER Green I會從DNA上分離出來,會產生彌散狀條帶。
(2) 用點染方法染色時,條帶稍有滯后現象,如果需要確定片段精確分子量(與Marker對比),建議使用膠染法(方法1)。
(3) 在常規用酒精沉淀核酸的過程中,SUPER Green I可以全部從雙鏈核酸上去掉。
(4) 如果想對用 SUPER Green I 染過的膠進行 Southern blots,建議在預雜化和雜化溶液中加入 0.1%~0.3% 的SDS。
(5) 在紫外照射透視下,與雙鏈 DNA 接合的 SUPER Green I呈現綠色熒光。如果膠中含有單鏈 DNA 則顏色為橘黃而不是綠色。
(6) SUPER Green I對玻璃和非聚丙烯材料具有一定親合力。建議在稀釋、貯存、染色等使用過程中用聚丙烯類容器。

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